Kristijan Naumovski a ajuns la Dinamo în 2010 de la clubul macedonean Rabotnicki Skopje, pentru suma de 100.000 de euro. Patru sezoane a evoluat portarul pentru Dinamo, care a concurat atunci cu Cristi Bălgrădean pentru postul de titular.
Sub comanda lui Dario Bonetti, Naumovski a fost titular în finala Cupei României din 2012, câştigată de alb-roşii cu 1-0 în faţa Rapidului. Macedoneanul s-a despărţit de Dinamo în 2014, fiind transferat în Bulgaria, la Levski Sofia, unde nu a rezistat doar 7 luni, ”Kiko” revenind în Ştefan cel Mare.
La finalul sezonului 2014-2015, portarul macedonean alegea să părăsească ”haita”, cu destinaţia Hong Kong. Naumovski a evoluat timp de două sezoane pentru Hong Kong Pegasus FC, iar din vara anului 2017 este liber de contract.
Începând de ieri, portarul de 29 de ani este noul jucător al celor de la Birkirkara FC, echipă aflată pe locul 8 în campionatul Maltei. Sezonul trecut, cei de la Birkirkara au încheiat sezonul pe locul 3.
Echipa din Malta este a şasea din cariera macedoneanului, după Rabotnicki Skopje, Dinamo, Levski şi Hong Kong Pegasus. Naumovski are în palmares Cupa şi Supercupa României cu Dinamo, şi Hong Kong FA Cup şi Sapling Cup cu HK Pegasus.
Doar Dinamo 